Март / 21 / 2019 / Четверг
Домой / Интересное / У трудного рецепторного белка увидели структуру

У трудного рецепторного белка увидели структуру

Важный для эмбрионального развития рецептор отличается от своих коллег формой своего молекулярного кармана, которым он сидит в клеточной мембране.

Рецепторы в клеточной мембране взаимодействуют с сигналами из внешней среды, сообщая информацию о них молекулам внутри клетки. (Фото: Enzymlogic / Flickr.com)

Трансмембранная часть GPCR-белков – это семь спиралей, которые проходят через мембрану туда и обратно. (Иллюстрация: Wikipedia) 

Действие многих лекарств основано на том, что они связываются с тем или иным белком, влияя на его работу. Это может быть фермент или, например, белок-рецептор, который сидит на поверхности клеток и передаёт внутрь неё сигналы из окружающей среды.

Но чтобы не искать вслепую и гарантированно найти вещество, которое эффективно будет взаимодействовать с нужным белком, нужно знать структуру этого белка. И речь идёт не просто последовательности аминокислот в белковой цепи, а о пространственной структуре. Именно от трехмерной структуры, уникальной для каждого вида белковых молекул, зависят их функции – способность связывать какие-то соединения, способность ускорять биохимические реакции и пр.

Для изучения трехмерных «портретов» белков в молекулярной биологии есть целый спектр методов. Но белков на свете много, и не все они одинаково этим методам поддаются. Например, белки-рецепторы группы GPCR (G protein-coupled receptors – рецепторы, сопряжённые с G-белком). Их называют так потому, что они работают в паре с G-белком – внутриклеточным передатчиком сигнала; если рецептор сидит в наружной мембране, он (рецептор) ловит какую-то физико-химическую информацию из внешней среды и при этом у него меняется пространственная структура – разные части молекулы рецептора двигаются друг относительно друга. Рецептор пронизывает мембрану насквозь, так что если с ним что-то происходит, это чувствуют напарники с внутренней стороны мембраны – например, G-белок.

В организме человека насчитывают около 800 GPCR-рецепторов. По словам Петра Попова, сотрудника лаборатории структурной биологии Московского физико-технического института (МФТИ), 30–40% лекарственных препаратов работают как раз с GPCR-рецепторами. Структурные исследования этих белков необычайно важны, однако на сегодняшний день мы знаем структуры лишь около пятидесяти из них, причём большая часть из них относится к одной и той же подгруппе внутри класса GPCR – к подгруппе А. Если говорить о другой подгруппе – подгруппе F – то из неё до сих пор удалось справиться только с одним белком. Интерес же к подгруппе F подогревает то, что попытки создать лекарства, которые бы работали с белками из F, очень часто заканчиваются ничем.

Шифань Ян (Shifan Yang) из Шанхайского технического университета, Петр Попов и коллеги из других научных центров Китая и США взялись изучить структуру другого GPCR-рецептора из группы F – рецептора FZD4. Он играет важную роль в эмбриональном развитии, а мутации в нем связаны с несколькими наследственными заболеваниями.

Исследователи хотели узнать структуру трансмембранного домена FZD4, то есть той части молекулы, которая сидит прямо в мембране и передаёт сигнал от той части рецептора, что смотрит наружу, к той, что обращена внутрь, в цитоплазму. Чтобы узнать структуру этой трансмембранной части, нужно было закристаллизовать ее для рентгеноструктурного анализа. Но белок оказался при таких манипуляциях нестабилен. Чтобы его стабилизировать, авторы работы изменили в нем некоторые аминокислоты так, чтобы структура белка осталась прежней, но чтобы одновременно она стала более устойчивой к исследовательским методам.

В результате удалось расшифровать пространственную структуру трансмембранной части FZD4 и понять, почему на такие белки не действуют лекарства, созданные к похожим рецепторам. Та часть рецептора, которая погружена в мембрану, пронизывает ее несколько раз; в результате цепь белка образует в липидной мембране гидрофильный карман.

Подобный карман есть у множества рецепторов, и именно с карманом связываются разнообразные молекулы, в том числе и лекарственные. Но у FZD4, как говорится в статье в Nature, карман совершенно другой формы, и потому для него нужны особые лекарства. И, возможно, в ближайшее время как раз и появятся такие лекарства, помогающие против заболеваний, связанных с FZD4 и ему подобными белками.



Источник

Проверьте также

«Руль лысый, сиденья просижены»: Блогер рассказал, как ему «подложили свинью» при покупке Hyundai Solaris

Профессиональный перекупщик рассказал о том, как обнаружил достойный подержанный «Солярис» и едва не стал жертвой …

Рассмотрение дела о «снежном картеле» в Петербурге отложено до 29 апреля

В Санкт-Петербурге состоялось заседание, на котором рассматривалось дело о так называемом «снежном картеле». Ряд организаций …

Посетитель «Макдоналдса» проткнул язык иголкой из гамбургера

В гамбургер попала иголка длиной 1 см ТАЙВАНЬ, 21 марта, ФедералПресс. Посетитель «Макдоналдса» проткнул язык …

«Такой ВАЗ и купить не стыдно»: Сеть восхитил «Жигуламбо» от народных умельцев

Прославленную отечественную «Семерку» мастера затюнинговали до неузнаваемости. Снимком спортивного ВАЗ-2107 поделилось тематическое сообщество любителей российского …

Яндекс.Метрика Рейтинг@Mail.ru